中文版Exploring Chemistry with Electronic Structure Methos,Second Edition.doc

Exploring Chemistry with Electronic Structure Method Second Edithion James B. Foresman Aeleen Frisch Gaussian, Inc Pittsburgh, PA 2002年9月25日  特别声明 本文转自南开大学BBS网站，在此对译者表示衷心感谢！！！！ 用Gaussian研究化学问题 说明 接触Gaussian已经很久了，但真正用做东西还是临近博士毕业时的事情。当时做计算的时候，就特别希望有一本具体怎么使用从头算的书，可惜一直没有找到。来到这里后，在新买的Gaussian98包中发现了这本书，感觉如获至宝，也希望能够提供给想用Gaussian做东西的朋友。我不是专门做量化的，很多术语不清楚怎么翻译，手头又没有中文的资料，错误的地方，只能希望内行来指点了。其实这本书里面介绍的东西，不止限于Gaussian程序的。对于从事从头算研究的都有帮助。内容中有很多计算实例，都是在Gaussian94，98程序中提供的。节译自Exploring Chemistry with Electronic Structure Methos，Second Edition，作者James B。Foresman，Eleen Frisch出版社Gaussian，Inc，USA，1996 目 录 特别声明 １ 用Gaussian研究化学问题 １ 说明 １ 前言 1 运行Gaussian 2 Unix/Linux平台 2 Windows平台 2 输出文件 2 第一章 计算模型 4 1.1 计算化学概述 4 分子力学理论 4 电子结构理论 4 密度泛函(Density Functional Methods) 4 1.2 化学模型(Model Chemistries) 5 定义化学模型 5 模型的组合 5 第二章 单点能计算 6 2.1 能量计算设置 6 路径 6 计算的名称 6 分子结构 6 多步计算 7 2.3 输出文件中的信息 7 标准几何坐标。 7 能量 7 分子轨道和轨道能级 7 电荷分布 7 偶极矩和多极矩 7 CPU时间和其他 7 2.4 核磁计算 8 第三章 几何优化 10 3.1 势能面 10 3.2 寻找极小值 10 收敛标准 10 几何优化的输入 11 检查优化输出文件 11 3.3 寻找过渡态 11 3.4 难处理的优化 11 第四章 频率分析 14 4.1 预测红外和拉曼光谱 14 频率计算的输入 14 频率和强度 14 矫正因子和零点能。 15 简正模式 15 热力学 16 零点能(Zero Point Energy)和内能(Thermal Energy) 17 极化率和超极化率 17 4.2 表征稳定点 17 下面列出了需要描述稳定点时必须考虑的问题 18 第五章 基组的影响 21 5.1 最小基组 21 5.2 分裂基组 21 5.3 极化基组 21 5.4 弥散函数(Diffuse Functions) 22 5.5 高角动量基组 22 5.6 第三周期以后的原子的基组 22 第六章 选择合适的理论模型 25 6.1使用半经验方法 25 半经验方法的局限性 25 6.2 电子相关和后SCF方法 26 Hartree-Fock理论的限制 26 MPn方法 26 6.3 耦合簇(Coupled CLuster)和二次结构相关(Quadratic ConfigurationInteraction)方法 27 密度泛函方法 27 6.4 资源的使用 29 第七章 高精度能量模型 31 7.1 预测热化学 31 原子化能 31 电子亲和势 31 离子化能 31 质子亲和能 31 7.2 理论模型的评价 32 7.3 G2分子基(Molecule Set)以及缺陷及对缺陷的解释 32 7.4 理论模型的相对精确性 32 7.5 组合方法 33 Gaussian-1 和 Gaussian-2理论 33 完全基组方法(Complete Basis Set Motheds，CBS) 34 练习 35 第八章 研究化学反应和反应性 36 8.1 预测电子密度 36 8.2 计算反应焓变 36 8.3 研究势能面 37 8.4 势能面扫描 38 8.5 反应路径分析 38 运行IRC 38 8.6 势能面研究实例 39 甲醛的解离 39 优化过渡态 39 频率分析 39 IRC计算 40 计算活化能 40 1，2氢迁移反应 40 IRC的注意事项 40 8.7 等构反应(Isodesmic Reactions) 41 等构反应的局限 41 第九章 激发态计算 46 9.1 运行激发态计算 46 9.2 激发态优化和频率分析 46 第十章 溶液中的模