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蛋白质组学期末复习 基因组genome：一个细胞或病毒所包含的全部基因。通常在真核生物中指一个物种的单倍体染色体组所含有的一整套基因。原核生物一般只有一个环状DNA分子，其上含有的基因为一个基因组。 基因组学genomi cs：从基因组整体水平上对基因的活动规律进行阐述。 功能基因组学：利用结构基因组学提供的信息，通过在基因组或蛋白质水平上全面分析基因功能，使生物学研究从单一转向系统。其主要研究内容包括：基因功能发现，基因表达分析，突变检测等。 蛋白质组：是由一个细胞，一个组织或一个机体的基因组所表达的全部相应的蛋白质。是一个整体概念。 蛋白质组学(Proteomics)： 是以蛋白质组为研究对象，从蛋白质整体水平上来认识生命活动规律的科学。蛋白质组学研究直接定位于蛋白质水平，从整体，动态，定量的角度去研究基因的功能，是后基因组计划的一个重要组成部分。是对特定时间或特定环境条件下，细胞内完整表达状况的研究，代表了正在工作的基因组的情况，是一个动态过程。集中于动态描述基因调节、对基因表达的蛋白质水平进行定量的测定、鉴定疾病、药物对生命过程的影响，以及解释基因表达调控的机制。 旨在阐明生物体内全部蛋白质的表达模式和功能模式，其内容包括蛋白质的表达与存在方式（修饰方式），结构与功能，以及各个蛋白质之间相互作用等。是一门以全面的蛋白质性质研究(如表达水平、转录修饰、相互作用等)为基础，在蛋白质水平对疾病机理、细胞模式、功能联系等方面进行探索的科学，包括表达蛋白质组学，细胞谱蛋白质组学以及功能蛋白质组学。 功能蛋白质组(functional proteome)：细胞内与某个功能有关或在某种条件下的一群蛋白质；又指特定时间、特定环境和实验条件下基因组活跃表达的蛋白质。 基因组与蛋白质组的异同点： 基因组 蛋白质组 相同点 都属于整体概念, 蛋白质组是基因组的反映，但不是一个基因组的直接产物 不同点 均一性和完整性 特殊性和多样性 非常稳定，不易发生改变 可变性，高度动态的 基因组在同一生物体的所有体细胞中是均一的，完整的，稳定的，成分不随时间变化（终身不变）；组成该有机体的所有不同细胞都共有同一个基因组。 蛋白质组的特殊性和多样性：蛋白质组具有很高的细胞特异性（不同组织细胞中，蛋白质的表达有着很大差异）；不同细胞有不同的蛋白质组；在生命发育不同阶段，同一细胞的蛋白质种类也是不一样的；正常状态与病理状态下，同一细胞内的蛋白质组成也不同；环境的改变也会造成细胞内的蛋白质组成也不同； 蛋白质组是动态的，可变的：一个有机体的不同细胞表达它的全蛋白的不同亚套；根据细胞的发育和生理状态，蛋白表达的亚套一刻不停地变化着；即使同一细胞在生长活动的不同 时期，在不同条件下，其蛋白质组也是在不断的改变之中。 蛋白质组学研究的必要性？ 基因组计划的研究存在局限性，具体体现在： 基因序列本身的局限性，并不是所有基因同时表达，而是根据环境和生理状况而定，即使知道全序列也不能完全清楚表达状况。 尽管通常情况下mRNA表达丰度决定了对应的蛋白质量，但是不能仅仅以mRNA的数据为基础预测蛋白质表达水平。蛋白质动态修饰和加工并非必须取决于基因序列，许多调节是在蛋白质的结构域中发生。这些修饰和结合通常是动态和可逆的，而且不能由基因序列来决定。 蛋白质组学研究的目的、内容分别是什么？ 研究目的主要有：分离蛋白，显示差异，将表现型与功能联系起来；寻找蛋白质之间的相互作用，动态地反映生物体所处的状态。 研究内容主要包括： .（1）. 蛋白质组研究体系的建立与完善： . 重要的生物学问题有关的功能蛋白质组研究：该部分内容涉及确定蛋白质、翻译后修饰的研究、功能的确定、分子药学、二维凝胶的差异显示、蛋白质－蛋白质相互作用的研究、蛋白质胞内分布与移位等。 蛋白质组学研究的策略主要有哪些？ 主要有两种策略，即依赖于分离的策略和不依赖于分离的策略。 依赖于分离的研究策略主要有：二维凝胶电泳结合质谱的研究方法；一步分离即一维凝胶电泳结合喷雾质谱的方法；其它垂直分离方法包括液相色谱和毛细管电泳等。 不依赖于分离的研究策略主要包括：蛋白质芯片方法、蛋白质识别分子方法如抗体抗原反应和噬菌体显示等。 蛋白质组学研究中蛋白样品的制备的重要性、制备的基本原则以及过程是什么？ 蛋白质组样品制备的重要性：蛋白质组样品分离成功的关键，直接影响蛋白质组研究结果，样品制备的失败很难通过后续工作的完善或改进获得补偿。 蛋白质组样品制备基本原则：尽可能提高样品溶解度，抽提最大量的总蛋白，减少蛋白质的损失；解除蛋白质之间以及与其它生物大分子的相互作用，使蛋白质完全处于变性状态和还原状态；减少对蛋白质以及蛋白质组的人为修饰。总之：尽可能简单，减少步骤 蛋白质组样品制备的一般过程 对细胞、组织等样品进