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不同生物CytochromeC的序列分析
不同生物Cytochrome C的序列分析
选取生物序列如下:
human being 人
MGDVEKGKKIFIMKCSQCHTVEKGGKHKTGPNLHGLFGRKTGQAPGYSYTAANKNKGIIWGEDTLMEYLENPKKYIPGTKMIFVGIKKKEERADLIAYLKKATNE
Pan troglodytes 黑猩猩
MGDVEKGKKIFIMKCSQCHTVEKGGKHKTGPNLHGLFGRKTGQAPGYSYTAANKNKGIIWGEDTLMEYLENPKKYIPGTKMIFVGIKKKEERADLIAYLKKATNE
Equus caballus 马
MGDVEKGKKIFVQKCAQCHTVEKGGKHKTGPNLHGLFGRKTGQAPGFSYTDANKNKGITWKEETLMEYLENPKKYIPGTKMIFAGIKKKTEREDLIAYLKKATNE
Gallus gallus 原鸡
MGDIEKGKKIFVQKCSQCHTVEKGGKHKTGPNLHGLFGRKTGQAEGFSYTDANKNKGITWGEDTLMEYLENPKKYIPGTKMIFAGIKKKSERVDLIAYLKDATSK
Danio rerio 斑马鱼
MGDVEKGKKVFVQKCAQCHTVENGGKHKVGPNLWGLFGRKTGQAEGFSYTDANKSKGIVWGEDTLMEYLENPKKYIPGTKMIFAGIKKKGERADLIAYLKSATS
Apis mellifera 蜂
MGIPAGDPEKGKKIFVQKCAQCHTIESGGKHKVGPNLYGVYGRKTGQAPGYSYTDANKGKGITWNKETLFEYLENPKKYIPGTKMVFAGLKKPQERADLIAYIEQASK
Taeniopygia guttata 斑胸草雀
MGDVEKGKKIFVQKCSQCHTVEKGGKHKTGPNLNGLFGRKTGQAEGFSYTDANKNKGITWGEDTLMEYLENPKKYIPGTKMIFAGIKKKGERADLIAYLKVATAK
Drosophila melanogaster 黑腹果蝇
MGSGDAENGKKIFVQKCAQCHTYEVGGKHKVGPNLGGVVGRKCGTAAGYKYTDANIKKGVTWTEGNLDEYLKDPKKYIPGTKMVFAGLKKAEERADLIAFLKSNK
Arabidopsis thaliana 阿拉伯芥1
MASFDEAPPGNAKAGEKIFRTKCAQCHTVEAGAGHKQGPNLNGLFGRQSGTTAGYSYSAANKNKAVEWEEKALYDYLLNPKKYIPGTKMVFPGLKKPQDRADLIAYLKESTAPK
Helianthus annuus 向日葵
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Conocephalum conicum 苔
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Chlamydomonas reinhardtii 衣藻
MSTFAEAPAGDLARGEKIFKTKCAQCHVAEKGGGHKQGPNLGGLFGRVSGTAAGFAYSKANKEAAVTWGESTLYEYLLNPKKYMPGNKMVFAGLKKPEERADLIAYLKQATA
通过BIOEDIT进行分析比对后分别得到如下两个图。
通过比对分析可得,所有列出的生物的Cytochrome C均以M起始。将动物氨基酸序列适当后推得到图1。
17、22、36、81、82、88、95、96均为易形成α螺旋的K,
23、26均为易形成α螺旋的C,
25均为易形成α螺旋的Q,
27、35均为易形成α螺旋的H,
41、77、103均为易形成α螺旋的L,
89均为易形成α螺旋的M。
19均为易形成β折叠的F,
57、76、83均为易形成β折叠的Y,
68均为易形成β折叠的W。
10、15、38、43、46、50、54、93均为易形成β转角的G
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