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ppt课件-讲几个实验技术的技巧性
实验二 RNA提取、 逆转录PCR * * (8:00~8:05) 实验回顾 实验一、基因组DNA的提取、 酶切及电泳 目的 DNA片段 质粒 TA载体 连接 重组质粒 目的 DNA 转化 无质粒的E.Coli 死亡 有质粒的E.Coli 存活 含抗生素培养基中生长 PCR 2-3min 平板筛选 实验二 RNA提取、逆转录PCR 实验内容 1、小鼠肝脏组织总RNA的提取; 2、RNA的琼脂糖凝胶电泳; 3、以总RNA为模板的逆转录反应; 4、以cDNA为模板的特定基因的RT-PCR: 注:本次实验扩增GAPDH基因(746bp) 5、 PCR产物的电泳及回收 (8:05~8:15) 总RNA 真核细胞的RNA主要分为: 1、mRNA: 1-5% 起始密码:AUG 终止密码:UAA,UAG,UGA。 5`鸟嘌呤7位甲基化—CH3修饰。 1)免受核酸酶破坏, 2)起始、促进蛋白质合成。 3`poly(A)尾巴结构 20--200个A. 翻译所必需。 2、tRNA: 10-15% 3、rRNA: 80-85% 大亚基60S: 28S=4718nt 5S=120nt 5.8S=160nt 小亚基40S: 18S=1874nt RNA提取操作注意事项 RNA分离的关键因素是减少RNA酶污染。 RNA酶是一类自然界中广泛存在、生物活性非常稳定的酶类。环境中的灰尘、人体汗液、唾液、实验器材表面。RNase耐热、耐酸、耐碱,不需要辅助因子就具有活性作用。 1、尽量避免外源性RNase 污染 a. 操作环境空气洁净。带手套、口罩。 b. 用新开封的化学试剂。(试剂应该专用) c.一次性塑料器材最好是新开封并经过DEPC水处理及高压灭菌。 d.玻璃器材、水都应该经过去RNase 处理。对玻 璃器材还应该进行高温烘烤。 2、应用RNase 抑制剂抑制内源性RNase 活性。 1)将1 ml Trizol 试剂分装到Eppendorf 管中备用。 2)实验教师操作: 取新鲜小鼠肝脏组织,组织块不宜过大,放在玻片上立即研磨,研磨要彻底。 3)将研磨后的组织(小米粒大小)转移至1 ml Trizol 试剂中,盖紧盖,上下颠倒混合2 min以上,使组织细胞充分裂解。肉眼观察可见液体变成均匀浑浊状。 4)室温孵育10 min。 (8:15~9:05) 发放口罩,帽子,每个组来一个人领取。 强调肝脏组织块不宜过大,研磨要彻底。 第一部分:提取小鼠肝脏组织的总RNA 1、异硫氰酸胍法: GuSCN 是一种强的蛋白质变性剂,能够裂解细胞的同时,还能有效地抑制内源性 Rnase的活性,通过有机溶剂的分步抽提,可获得纯度较高的细胞总RNA。 特点:需低温操作,但价格经济。 2、Trizol 试剂(商品化产品) 特点:在室温下可以提取细胞总RNA, 具有简单、快速、提取量大、纯度高的优点。 3、mRNA提取试剂盒 真核细胞mRNA的3末端有ploy(A)尾,利用寡聚 dT纤维素结合mRNA,将其从细胞总RNA中分离出来。 课间介绍 RNA提取的几种方法 室温孵育10 min RNase抑制剂介绍 1、DEPC, 二乙基焦炭酸盐 RNA操作时最常用的RNase抑制剂,对核酸酶有 很强的抑制作用。作用机制是与蛋白质中的组氨酸结合,使蛋白质变性。 使用方法:用来去除溶液中的RNase 。RNA提取中 所有液体试剂都应该用DEPC处理。 有效浓度:0.05%---0.1%,室温磁力搅拌20分钟。 灭活条件:高压消毒,或70 ?C 1 h。 在Tris溶液中半衰期为1
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