柱穗山羊草类燕麦储藏蛋白基因克隆和序列分析.docVIP

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柱穗山羊草类燕麦储藏蛋白基因克隆和序列分析.doc

柱穗山羊草类燕麦储藏蛋白基因克隆和序列分析   摘 要:从小麦近缘植物柱穗山羊草中克隆得到一个特殊的类燕麦储藏蛋白(Avenin-like protein)基因。其编码区比已知的类燕麦储藏蛋白编码基因长200 bp左右,是迄今发现的最大的类燕麦储藏蛋白,将其命名为AL-Y127。通过与已知的类燕麦储藏蛋白基因比较后发现,该蛋白家族在信号肽、N末端和C末端具有很高的保守性,而在重复区中则具有较大的序列差异。AL-Y127中有26个半胱氨酸残基,远多于已知的avenin-like蛋白中的半胱氨酸残基数目,这些半胱氨酸残基可能会参与形成更多的二硫键,有利于提高面粉的加工品质。   关键词:类燕麦储藏蛋白;基因克隆;序列分析   中图分类号:Q785 文献标识号:A 文章编号:1001-4942(2012)11-0001-05   Cloning and Sequence Analysis of Novel Avenin-Like Genes   from Aegilops cylindrical   Du XuYe1, 2, Zhou TingTing1, Xu JiKun1, Guo WeiHua1,   Zhao XiaoLong1, Zhai Jun1, 2, Kong LingRang1, 2*   (1.Agronomy College, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China;   2.State Key Laboratory of Crop Biology, Taian 271018, China)   Abstract A novel avenin-like gene was cloned from Aegilops cylindrical. Its coding region the gene was 200 bp longer than that of published avenin-like gene and it was named AL-Y127. This gene is the largest avenin-like gene so far. It showed that the signal peptide, N-terminal domain and C-terminal domain of avenin-like protein were highly conservative by comparing AL-Y127 and the other published avenin-like proteins. The repetitive domain displayed more variation based on protein sequence alignment. There were 26 cysteine residues in AL-Y127, which were much more than these of the avenin-like proteins in other species; they may form more disulfide bond which have the positive role in the processing quality of flour.   Key words Avenin-like proteins; Clone; Sequence analysis   小麦籽粒的储藏蛋白主要包括谷蛋白和醇溶蛋白,谷蛋白是多聚体蛋白,由分子内部的二硫键结合形成蛋白聚合体;而醇溶蛋白是一类单体蛋白,根据其在酸性电泳中的迁移率可以分为α、γ和ω醇溶蛋白三类。   类燕麦储藏蛋白是最近几年引起人们关注的一类储藏蛋白。最初,Salcedo等[1]报道了一种低分子量的醇溶蛋白,随后Anderson和Clarke[2,3]得到了此类蛋白的cDNA序列,Kan等[4]分析后认为此类蛋白与燕麦种子的储藏蛋白具有最近的亲缘关系,因此将其命名为类燕麦储藏蛋白(Aevnin-like protein)。根据其结构可将其分为两类:a型和b型类燕麦储藏蛋白。   序列分析表明,a型类燕麦储藏蛋白类似于低分子量谷蛋白亚基,通过蛋白组学分析和蛋白质分离已经得到了该类型的类燕麦储藏蛋白。目前对b型类燕麦储藏蛋白的研究较少,Kan等[4]发现,一些b型类燕麦储藏蛋白中含有19个半胱氨酸残基,认为它们可以通过分子链内的二硫键结合到谷蛋白聚合体中。   柱穗山羊草(CCDD)是小麦的近缘植物之一,由于其外形与粗山羊草十分相似,因此常常被误认为是粗山羊草。目前对它的研究较少。本文从柱

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