酶学(高级生化课件).ppt

* * * * * * Catalysis nitro phenylacetate imidazole * * * * * Glyceraldehyde phosphate * * Ks型的活泼化学基团和Kcat型的潜伏反应基团的区别 * Natural substrate for chymotrypsin， specifcity ，tosyl-l-phenylalanine chloromethyl ketone * * Triose , bromoacetol phosphate isomerase，bromoacetol phosphate， * * * Alkylation，stably modified of inactivates * * * * Pyrrole pyrroline ??pyrroline?planar transition 吡咯啉 carboxylate * * Enediolate phosphoglycolohydroxamate 磷酸乙二醇异羟肟酸盐?果糖1,6-二磷酸，enediolate ，transittion-state intermediate, yeast * * Calf intestinal inosine hydrated purine ribonucleoside * * * * Lysozyme polypeptide * * * * * * Uracil尿嘧啶 * * * glycosidic * reaction Coordinate ，angle of bend，boat，chair * Peptidoglycan，covalent，glycosyl carbocation intermediate lysozyme mechanism consistent current data original phillips * * * * Pocket carboxypeptidase * * * * * * * * * * * pepsin * flap * protease * Crixivan HIV protease Crixivan comlex * * * * * * Iodoacetamide,inactivated END The * 聚乙二醇，葡聚糖 * Hydrophobic reversed -phase * Ligand interest * * * * * * * * * * * Norvaline ester chymotrypsin preferences * Catalase crotonase anhydrase ,enzymes for which is close to diffusion-controlled rate of encounter * Random order * Pyruvate lactate ordered coenzyme notation * Creatine，phosphocreatine，random * ternary * Pyridoxal oxaloacetate * Aspartate，oxaloacetate ketoglutarate glutamate * * double Reciproval equation increasing concentration 2.4.5.5 Pyruvate Dehydrogenase Complex 硫胺素焦磷酸 反应过程 在复合物内进行的脱羧作用主要可分为5个步骤，丙酮酸与乙醘辅酶A的中间物在复合物里的移动过程，大致依照E1、E2的顺序，E3则没有直接与中间物接触。其中丙酮酸是在第一个步骤（E1中）加入反应，乙醘辅酶A是在第三个步骤（E2中）中生成。 A.在第一个步骤中，丙酮酸上的羧基会形成二氧化碳然后释出；中间的碳原子则会与E1中的TPP结合形成羟乙基TPP（Hydroxyethyl TPP），对丙酮酸来说是个氧化反应。这个步骤是所有步骤中最慢的一个，因此决定了整个反应的速率。 B.接下来TPP会将羟乙基带入第二个步骤，TPP本身则留在E1中继续作用。羟乙基氧化之后变成乙酰基，并进入E2，与硫辛酰基上的其中一个硫原子结合，已经氧化过的硫辛酰基离氨酸与乙酰基结合，成为酰基硫辛酰基离氨酸（Acyl lipoyllysine）。 C.第三个步骤在E2进行，酰基硫辛酰基离氨酸会与辅酶A进行反应，此反应会使硫辛酰基离氨酸还原，并释出乙酰辅酶A。硫辛酰基离氨酸则经过下一步骤的氧化之后回到第二步骤作反应。 D.第四个步骤中，E3的辅成基FAD会使上一步骤中还原的硫辛酰基离氨酸再度氧化，以回到第二步骤；而FAD经过