全基因组关联分筛查散发性鼻咽癌的易感基因.pdf

本项目由以下项目经费资助： 国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2004CB518604和 2006CB910104)， 国家自然科学基金项目30872929)， 国家自然科学基金委员会．广东省人民政府自然科学联合基金 (u0732005)。 特此致谢! 目录 缩写词表…………………………………………………………………………………………一1 中文摘要…………………………………………………………………………………………一2 Abstract···········································································································4 第一章 前言……………………………………………………………………………………6 1．1． 鼻咽癌病因学研究进展……………………………………………………………………7 1．2． ．鼻咽癌易感基因研究进展………………………………………………………………一8 1．3． 遗传易感基因筛查研究手段………………………………………………………………9 1．4． 研究思路………………………………………………………………………………一14 第二章 材料和方法…………………………………………………………………………·16 2．1． 研究样本募集……………………………………………………………………………·16 2．2．DNA准备和基因分型…………………………………………………………………一17 2．3． contr01)……………………………………………………………·18 质控检验(quality 2．4． 统计学分析：……………………………………………………………………………·20 2．5． 推算(imputation)：……………………………………………………………………·2l 2．6． 基因一基因相互作用：…………………………………………………………………2l 第三章 结果…………………………………………………………………………………·22 3．1． 全基因组SNP分型及质控分析…………………………………………………………22 3．2． 全基因组关联分析………………………………………………………………………·25 3．3． 关联SNP的验证…………………………………………………………………………30 3．4． 基因一基因相互作用……………………………………………………………………·31 3．5． 新加坡华人对照样本对关联分析结果的影响…………………………………………·32 3．6． 易感基因定位……………………………………………………………………………·33 3．7．HLd区域SNP关联的独立性分析……………………………………………………··36 第四章 讨论…………………………………………………………………………………·39 参考文献………………………………………………………………………………………··44 附表………………………………………………………………………………………………·49 附件l一个人简历………………………………………………………………………………·63 附件2一在站期间发表的论文和论著…………………………………………………：………64 附件3一在站期间获得的科研基金及承担的其它课题………………………………………·78 附件4一在站期间参加国内外学术会议情况…………………………………………………·79 附件5一在站期间承担教学和／或工作情况……………………………………………………·79 致谢………………………………………………………………………………………………·80 中山大学博士后研究工作报告 贝锦新 全基因组关联分析筛查散发性。． 洲Y…川1 洲8 mmj●l 圳5…5川7Ⅲ9 95％CI 95％confidence interval 95％置信区间 DNA acid Deoxyribonucleic 脱氧核糖核酸 EBV