001单核苷酸多态性与在水产动物遗传育种中应用.pdf

5 第15卷第4期 中国水产科学． V01．1No．4 2008 2008年7月 Joumalof SciencesofChina July Fishery ·综述· 单核苷酸多态性及其在水产动物遗传育种中的应用 刘福平hz，白俊杰1 (1．中国水产科学研究院珠江水产研究所中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放室，广东广州510380； 2．上海海洋大学生命科学与技术学院，上海200090) 摘要：单核苷酸多态性(sNPs)是广泛存在于基因组中的一类由单个碱基转换或颠换引起的DNA序列多态性。它是继 限制性片段长度多态性(RFLP)、微卫星标记(ssR)之后的新一代分子标记，已广泛应用于构建遗传连锁图谱、Q，rL定 位、关联分析及研究群体遗传结构与亲缘关系等方面。本文主要介绍了sNPs的概念、特点及检测sNPs的主要方法，综 述了SNPs在水产动物遗传育种中的研究进展，以期将SNPs更广泛地应用于水产动物群体遗传、分子标记辅助育种和 生物进化等研究领域。[中国水产科学，2008，15(4)：704-712] 关键词：单核苷酸多态性；分子标记；水产动物；遗传育种 中图分类号：Q953 文献标识码：A 文章编号：1005—8737一(2008)04—0704一09 遗传标记主要分为形态学标记、细胞学标记、 度多态性标记和微卫星标记之后的第3代遗传标 生化标记和DNA分子标记4种类型。近年来，记，它分布广泛、数目多且相对稳定地存在于各类 DNA分子标记辅助育种作为一种新的育种方法在 生物的染色体上，近年来正被越来越多的应用于人 全世界兴起，它是通过利用与目标性状紧密连锁 类遗传性疾病诊治和动物遗传结构分析等研究领 的DNA分子标记对目标性状进行间接选择的现代 域b1。本文将主要论述SNPs的特点、盼旧s主要 育种技术。与常规育种相比，该技术不仅可在早期 检测方法和SNPs在水产动物育种中的应用，旨在 进行准确、稳定的选择，而且解决了再度利用隐性 将SNPs更广泛的应用于水产动物群体遗传、分子 基因识别难的问题，有效地克服了常规育种过程中 标记辅助育种和生物进化等研究领域。 所采用的形态学标记存在的数目少、受环境影响较 1 SNPs的概念和特点 大，不易直接选择的不足，从而加速育种进程，可提 1．1 SNPs的概念 高育种效率2~3倍。目前常用的DNA分子标记技 术主要包括：限制性内切酶酶切片段的长度多态性 sNPs主要是指在基因组水平上由于单个核苷 酸的变异所引起的DNA序列多态性，即同一物种 (RFLP)、随机扩增DNA多态性(黜垤D)、DNA指 不同个体问染色体上遗传密码单个碱基的变化。 纹印迹(Ⅸ墟)、扩增片段长度多态性(AFLP)、微 常表现为单碱基的转换、颠换、插入和缺失，但通常 卫星DNA(SSR)、单核苷酸多态性(SNPs)等。单 N．ucleotide 所指的SNPs不包括后两种情况，即插入和缺失；满 核苷酸多态性(Sin鲥e Polymorphisms，简 足SNPs条件的另一规定是其中一种等位基因在 称SNPs)这个术语最早于1994年出现在人类分子 遗传杂志上，随后美国麻省理工学院学者L姐der… 群体中出现的频率应不小于l％H