ROC曲线的统计学实验报告.docVIP

上海大学2014～2015学年 秋 季学期研究生课程报告 课程名称： 生物医学测量及仪器 课程编号： 07SBE7002 论文题目: 基于甲胎蛋白诊断肝癌的ROC曲线绘制及AUC计算 研究生姓名: 廖小金 学 号: 论文评语: 成 绩: 任课教师: 评阅日期: 摘要 在检验某一物质对疾病的诊断效果时，ROC曲线是一个重要的统计学分析方法。其以真阳率作为纵坐标，假阳率作为横坐标，随诊断临界值的移动而形成一条连续的曲线。曲线下的面积AUC是判断诊断效果的一个依据，面积越接近于1效果越好。显著性差异可以帮助判断样本是否来自同一总体，也可以因此评价诊断方法的效果。 Abstract In the examination of the effect of a substance for the diagnosis of a disease, ROC curve is a significant statistic analysis. It set the true positive rate as ordinate, the false positive rate as the horizontal axis, and forms a continuous curve with the change of diagnostic threshold . AUC area under the curve is a parameter for judging the effect of diagnosis, and the more it closes to 1 ,the better effect it implies. Significant difference can help judge whether the samples are from the same population, and therefore can also evaluate the effectiveness of the diagnostic method. 概论 1.1 甲胎蛋白与肝癌 甲胎蛋白是一种糖蛋白，主要来自胚胎的肝细胞，胎儿出生后约两周甲胎蛋白从血液中消失，因此正常人血清中甲胎蛋白的含量尚不到20微克/升。但当肝细胞发生癌变时，却又恢复了产生这种蛋白质的功能，而且随着病情恶化它在血清中的含量会急剧增加，甲胎蛋白就成了诊断原发性肝癌的一个特异性临床指标。 过去一直认为是诊断原发性肝癌的特异性肿瘤标志物，具有确立诊断、早期诊断、鉴别诊断的作用。大量的临床却发现，部分肝硬化病人会长期出现AFP达到上千，但多年都没有肝癌的迹象；同时发现约20%的晚期肝癌病人，直至病故前，AFP仍不超过10。也就是说，尽管甲胎蛋白是检验肝癌的有效的指标，但肝癌患者不一定甲胎蛋白检验呈阳性（80%呈阳性），而AFP检验呈阳性的人也不一定是肝癌患者。这就涉及到对诊断试验评价的问题，我们课程中所学的假设检验、ROC曲线绘制及AUC计算正是针对这类问题的方法之一。 1.2 诊断试验的评价指标 显著性差异 显著性差异是检验假设是否合理的一个方法。例如在本项目中，用甲胎蛋白作为肝癌的诊断指标，若这两组实际数据有显著性差异，基于此，它们所来自的各自的总体不具有显著性差异的概率p是多少？p达到一个足够小的值时，认为总体具有显著性差异，以此说明甲胎蛋白作为诊断指标是一个有力的依据。一般取这个足够小的值为0.05或0.01，本项目中取0.05。 ROC曲线 如上图所示，在评价诊断试验时，患者中被诊断试验正确判断为阳性的比例亦叫真阳性率(true positive rate, TPR)，也称灵敏度；非患者中被诊断试验正确判断为阴性的比例亦叫真阴性率(true negative rate, TNR)，也称特异性；患者被诊断试验错误地判断为阴性的比例称为假阴性；非患者被错误地诊断为阳性的比例称为假阳率。而ROC曲线是以灵敏度为纵轴，假阳率为横轴，通过不同的诊断临界值的移动绘制而成的曲线。多条曲线进行比较时，曲线下的面积越大，说明诊断越准确。将绘成的曲线与斜45度的直线对比,若差不多重合,说明自变量对因变量的判定价值很差,若越远离斜45度的直线,说明自变量对因变量的判定价值越好。分析单个曲线时，越靠近左上角的点所对应的诊断临界值越好，例如本项目中的。 1.3项目数据： 测得正常人及肝病患者的甲胎蛋白(AFP)