条纹斑竹鲨基因组的RAPD分析初报PreliminaryReportontheGenomeRAPDAnalysisoftheChilos.pdfVIP

遗传 HEREDITAS(Beijing)21(1):4一51999 条纹斑竹鳖基因组的RAPD分析初报 吴 冰少 陈元霖 桂慕燕 福（建省厦门大学细胞生物学研究室，厦门361005) 摘 要 采用 11种随机引物对4条条纹斑竹鳖基因组进行了RAPD检测。结果表明，11种引物在每条 个体上扩增的DNA片段总数在77-84之间，单个随机引物扩增的DNA片段数目由1至11条不等，平 均为7.5条DNA片段，片段的大小在300--2800bp之间．个体之间的相似率在90％以上。 关键词 条纹斑竹鳖，基因组DNA,RAPD分析 中图分类号 Q953,Q523 PreliminaryReportontheGenomeRAPDAnalysis oftheChiloscylliumPlagiosum WUBing CHENYuan-Lin GUIMu-Yan (LaboratoryofCellBiology,XiamenUniversity,Xiamen361005) Abstracts 4individualsofChiloscylliumplagiosumwereanalyzedbyRAPDmethodusing11arbitrary primers.Forthe11arbitraryprimers,eachindividualshowed77一84bandscorrespondingtoamplified products.Eachprimergave1～11bandsforeachindividual.Onaverage,about7.5bandswereobtained perprimerperindividual.Thelengthofthefragmentis300一2800bp.Thesimilaritybetweenbandpro- filesofthefourindividualswasover90% . KeywordsChiloscylliumplagiosum,Genome,RAPD DNA分子的多态性分析是进行基因组研究的基础。1990年，两个实验室几乎同时建立了运用随机引物扩增 寻找多态性DNA片段作为分子标记的方法，即RAPD(RandomamplifiedpolymorphicDNA，随机扩增多态性 DNA).RAPD技术是在PCR技术的基础上建立起来的，它是通过利用单一的随机合成的10碱基寡聚核昔酸作 为引物 对基因组进行PCR扩增，这些扩增产物DNA片段的多态性，反映了基因组相应区域的DNA多态性 由 于RAPD技术可应用于无任何分子生物学研究基础的物种，方法简单、快捷、已在动植物育种、种群遗传学及生 物多样性等研究中得到了广泛应用曰2) 条纹斑竹kJ(Chiloscylliumplagiosum）在鱼类分类学中属软骨鱼纲，是厦门地区常见的一种海洋低等经济鱼类， 有科学研究和食用价值。本文应用RAPD技术对条纹斑竹鉴的遗传多样性进行了初步研究。 1材 料 与 方 法 1.1基因组DNA提取和纯化 条纹斑竹鳖购自厦门市农贸市场。剖取鲜活条纹斑竹鳖的肝脏，置玻璃匀浆器中，加缓冲液 1（00mmol;L Tris-HCI,pH8.0,500mmol/LNaCl,5mmo1/LEDTA,1.25%SDS）洗涤、剪碎、匀浆，随后进行氯仿：异戊醇 抽提和乙醇沉淀，经RNA酶和蛋白酶K常规消化处理后，再用酚 ：氯仿 ：异戊醇抽提进行纯化，乙醇沉淀·洗 涤，干燥后加TE(Ommol/LEDTA,lOmmol/LTris-HCI,pH8.0)溶解，-201C冰箱贮存备用。 I昊 冰 女 29岁 硕士．专业方向为细胞生物学；现工作单位：暨南大学 “211工程”办公室 广州 510632. 1期 昊 冰等：条纹斑竹置基因组的RAPD分析初报 5 1.2RAPD检测 RAPD扩增引物为美国Operon公司产品，引物的编号及其序列如表1.Taq酶及dNTP为华美生物工程公 司产品。PCR扩增仪为PerkinElmerCetus公司产品，型号为PE480e