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Research Paper 研究报告
微生物学报A cta M icrobiolog ica Sinica
52 (7 ):894 - 90 1 ;4 July 20 12
ISSN 000 1 - 6209 ;CN 11 - 1995 / Q
http :/ / journals. im . ac . cn / actamicrocn
3 次连续重复提取DNA 能较好反映土壤微生物丰度
1 ,2 2 2 1 * 2 2 2 *
, , , , , ,
郭赟 吴宇澄 林先贵 钟文辉 丁维新 朱建国 贾仲君
1 , 2 10046
南京师范大学地理科学学院 南京
2 , , 2 10008
中国科学院南京土壤研究所 土壤与农业可持续发展国家重点实验室 南京
:【 】 ,
摘要 目的 研究同一个土壤需要反复提取几次才能在最大程度上反映土壤微生物的丰度 探讨风干土壤
。【 】
代替新鲜土壤用于微生物丰度研究的可行性 方法 针对两种理化性质具有较大差异的旱地和稻田新鲜
土壤及其风干土壤, 5 DNA 。 PCR
分别对土壤微生物进行 次连续裂解提取 通过实时荧光定量 技术分析连续
16 S rRNA gene 、 amoA 。【 】3
反复提取对土壤古菌和细菌 数量 氨氧化古菌和细菌功能基因 数量的影响 结果
DNA 5 DNA 76 % , 、 、 4 3
次连续提取 占 次提取 总量的 以上 氨氧化古菌 氨氧化细菌 古菌和细菌 类微生物的
77. 5 % ; , 、 、 、
次连续提取最低回收率为 与新鲜土壤相比 风干处理导致氨氧化古菌 氨氧化细菌 古菌 细菌的数
84 . 3 % 、8 1. 2 % 、12. 5 % 90. 3 % , ,2
量分别降低 和 然而 种土壤风干过程中主要微生物类群的数量变化规律基
, 。【 】 3
本一致 表明土壤微生物对风干处理的响应可能受土壤类型的影响较小 结论 土壤微生物连续 次裂解
。 , , ,
能较好反映微生物丰度 与新鲜土壤相比 风干过程显著降低了土壤微生物丰度 然而 通过风干土壤中微
生物丰度的变化趋势反映新鲜土壤中微生物数量变化规律具有一定的可行性。
: DNA , , , , ,
关键词 土壤 连续提取 风干处理 古菌 细菌 氨氧化古菌 氨氧化细菌
中图分类号:Q938 文
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