ERIC2PCR技术特点及其应用.pdfVIP

安徽农业科学 ,Journal of Anhui Agri. Sci. 2007 ,35 ( 18) :5358 - 5360 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　责任编辑　孙红忠　责任校对　李洪 ERICPCR 技术特点及其应用 ( ) 李犹平 , 倪学勤 　 四川农业大学动物科技学院, 四川雅安 625014 摘要　ERIC 序列是近年来发现的存在于原核生物基因组中一类短的重复序列。该序列在染色体上的分布和拷贝数具有种间的特异 性 ,根据序列中心高度保守的44 bp 的 ERIC 核心序列设计反向引物 ,可扩增出反映细菌基因组结构特征的谱带。由于 ERICPCR 快速简 便 , 图谱重复性好,能用于细菌分类鉴定、环境监测、污染治理以及人和动物肠道菌群结构研究等方面。 关键词　ERIC;IRU ;ERICPCR ;特点 ;应用 ( ) 中图分类号　Q503 　　文献标识码　A 　　文章编号　0517 - 6611 2007 18 - 05358 - 03 Characteristic and Application of the Enterobacterial Repetitive Intergenic ConsensusPCR (College of Animal Science and Technology ,Sichuan Agricultural University ,Yaan ,Sichuan 625014) LI Youping et al 　 Abstract 　Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus ( ERIC) ,a kind of short duplication sequences ,is found to exist in the genome of prokaryotic or ganism. Distribution and copy of the sequence in chromosome is interspecific specificity. According to the highly conservative core sequence ,44bp ,reverse primer is designed. ERICPCR can generate unique fingerprints to reflect the structural feature of bacterial strains ,and can identification species. ERIC PCR technique can be used in the identification of bacterium ,environmental monitoring ,investigation intestinal flora of human beings and animals ,which is rapid ,simple and repetitive. Key words 　ERIC;IRU ;ERICPCR ;Characteristic ;Application 　　传统的微生物分类鉴定方法是基于微生物的表型特征 , 　　ERIC 的功能目前还不太清楚, 只是根据它的结构作了 如生长、营养、生理生化等 ,只能检测可培养的细菌 ,且费时、 一些猜测。认为位于基因 3′末端的ERIC 可能由于形成二级 费力 ,易受操作方法影响。近年来随着分子生物学技术的发 结构后 ,其茎环结构防止外切核酸酶对基因 3′末端的降解, 展 ,如 PFGE 、RFLP 、ARDRA 、RAPDPCR 、DGGEPCR 、ERICPCR 促进上游基因的表达 ; ERIC 在基因组间的位置和拷贝数具 等越来越多地应用于微生物种群结构特征 ,系统多样性和动